İki amino asidin etkileşiminden sonra peptit proteinlerinin oluşumu sırasında oluşan amid bağı türü, peptit bağı nedir sorusunun cevabı budur.
Bir çift amino asitten bir dipeptit, yani bu amino asitlerin bir zinciri artı bir su molekülü ortaya çıkar. Aynı sisteme göre ribozomlardaki amino asitlerden yani polipep titlerden ve proteinlerden daha uzun zincirler üretilir.
Zincir Özellikleri
Proteinler için bir tür "yapı malzemesi" olan çeşitli amino asitler, radikal bir R'ye sahiptir.
Herhangi bir amidde olduğu gibi, karbonil karbon ve nitrojen atomu arasındaki kanonik yapıların etkileşimi yoluyla C-N zincir proteininin peptit bağı genellikle çift özelliğe sahiptir. Bu genellikle uzunluğunu 1,33 angstrom'a düşürmede ifadesini bulur.
Bütün bunlar şu sonuçlara yol açar:
- C, H, O ve N - 4 bağlı atom, artı 2 a-karbon aynı düzlemde bulunur. amino asitlerin R grupları vea-karbon hidrojenleri zaten bu bölgenin dışında.
- Amino asitlerin peptit bağındaki H ve O ve amino asit çiftinin a-karbonları, trans-izomer daha kararlı olmasına rağmen, trans yönelimlidir. L-amino asitlerde, R grupları da doğada bulunan tüm pep titlerde ve proteinlerde bulunan trans yönelimlidir.
- C-N zinciri etrafında dönüş zordur, CC bağlantısında dönüş daha olasıdır.
Peptid bağının ne olduğunu anlamak ve pep titlerin kendilerini proteinlerle tespit etmek ve belirli bir çözeltideki miktarlarını belirlemek için biüret reaksiyonunu kullanın.
Atomların dizilişleri
Protein pep titlerindeki bağlantı, kısmi çift bağ özelliğine sahip olduğu için diğer peptit gruplarına göre daha kısadır. Peptit bağının ne olduğunu düşünürsek, hareketliliğinin düşük olduğu sonucuna varabiliriz.
Peptid bağının elektronik yapısı, bir peptit grubunun katı düzlemsel yapısını belirler. Bu tür grupların düzlemleri birbirine açılı olarak yerleştirilmiştir. a-karbon atomu ile a-karboksil ve a-amino grupları arasındaki bağ, kendi ekseni boyunca serbestçe dönebilmekte, ancak boyut ve radikallerin doğası sınırlı olmakta ve bu, polipeptit zincirinin kendisini çeşitli şekillerde ayarlamasını mümkün kılmaktadır. ayarlar.
Proteinlerdeki peptit bağları, kural olarak, trans konfigürasyonundadır, yani a-karbon atomlarının düzenlenmesi, grubun farklı bölümlerinde bulunur. Sonuç, amino asitlerdeki yan radikallerin uzayda birbirinden daha uzak bir mesafede konumlanmasıdır.arkadaş.
Protein yırtılması
Bir peptit bağının ne olduğu incelenirken, gücü genellikle dikkate alınır. Bu tür zincirler hücre içinde normal koşullarda kendi kendilerine kırılmazlar. Yani uygun bir vücut sıcaklığında ve nötr bir ortamda.
Laboratuvar koşullarında, protein peptit zincirlerinin hidrolizi, içinde konsantre hidroklorik asit bulunan kapalı ampullerde, yüz beş santigrat derecenin üzerinde bir sıcaklıkta incelenir. Serbest amino asitlere tam protein hidrolizi yaklaşık 24 saat içinde gerçekleşir.
Canlı organizmaların içindeki peptit bağı nedir sorusu üzerine, belirli proteolitik enzimlerin katılımıyla kopmalar meydana gelir. Bir çözeltideki pep titleri ve proteinleri bulmak ve bunların miktarını öğrenmek için iki veya daha fazla peptit bağı içeren maddelerin pozitif sonucunu yani biüret reaksiyonunu kullanırlar.
Amino asit değişimi
Anormal hemoglobin S içinde, glutamatın yanı sıra altıncı pozisyondaki negatif yüklü yüksek polar amino asidin, radikal içeren hidrofobik bir valin ile değiştirildiği 2 β-zinciri mutasyona uğradı.
Mutasyona uğramış hemoglobinin içinde, değiştirilmiş amino asidi içeren aynı moleküllere sahip başka bir bölgeyi tamamlayan bir bölge bulunur. Sonuçta, hemoglobin molekülleri "birbirine yapışır" ve kırmızı kan hücresini değiştiren ve mutasyona uğramış hilal şeklinde bir kırmızı kan hücresinin görünümüne yol açan uzun fibriller kümeleri oluşturur.
Oksihemoglobin S'nin içinde, protein yapısındaki bir değişikliğin bir sonucu olarak, tamamlayıcı bir bölge maskelenir. Buna erişimin olmaması, bu oksihemoglobinde moleküllerin birbirine bağlanmasını imkansız hale getirir. HbS agregatlarının oluşumuna elverişli koşullar vardır. Hücrelerin içindeki deoksihemoglobin birikimlerini arttırırlar. Bunlar şunları içerebilir:
- hipoksi;
- alp koşulları;
- fiziksel emek;
- uçak uçuşu.
Orak Hücre Anemisi
Orak şeklindeki eritrositler doku kılcal damarlarından düşük geçirgenliğe sahip olduklarından kan damarlarını tıkayabilir ve böylece yerel hipoksi oluşturabilirler. Bu, kırmızı kan hücrelerinin içinde deoksihemoglobin S birikimini ve ayrıca S-hemoglobin kümelerinin ortaya çıkma hızını artıracak ve kırmızı kan hücresi deformasyonu için daha da fazla koşul yaratacaktır.
Orak hücre hastalığı, yalnızca her iki ebeveyn de bir çift mutasyona uğramış β-zincir genini geçtiğinde ortaya çıkan homozigot çekinik bir hastalıktır. Bebek doğduktan sonra, büyük miktarda HbF, HbS'ye dönüşene kadar hastalık kendini göstermez. Hastalar, aneminin özelliği olan klinik semptomlar gösterirler, yani: baş ağrısı ve baş dönmesi, çarpıntı, nefes darlığı, enfeksiyonlara karşı güçsüzlük vb.
